📊ggpubr - 让科研图表高效“出版就绪”的R扩展包

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1. 包介绍与安装

  • 全称：ggplot2-based publication-ready plots
  • 开发者：Alboukadel Kassambala
  • 定位：ggplot2 的增强包，专为学术/医学/生物数据领域的科研人员，简化绘图和统计
  • 安装：

    2. 快速科学绘图函数

    2.1 快捷函数

    • ggscatter() — 散点图，自动加回归线、置信区间、相关系数
    • ggboxplot() — 箱线图，主打分组对比、批量统计标注
    • ggbarplot() — 条形图，支持分组、均值、误差线等

    例1：带回归线和相关系数的散点图

    例2：分组箱线图+自定义配色

    3. 统计分析和显著性标注

    3.1 添加全局和分组检验

    • stat_compare_means() — 一行代码加 p 值/星号，无需自己写 test
    • 支持 t.test、wilcox.test、anova 等方法

    例3：箱线图自动标注分组检验结果

    4. 一键美化：theme_pubr() 和布局

    4.1 论文级主题

    • theme_pubr() — 极简、无网格、四边框，自动出版感
    • 可调字体大小、边框、图例等

    4.2 快速拼版：ggarrange vs patchwork

    • ggarrange()：适合传统拼版，语法简洁
    • 推荐 patchwork（更现代、灵活，见专文）

    5. 常用出版配色

    • palette = "npg"（Nature），"jco"（JCO），"lancet"（Lancet）等
    • 适合直接复用期刊级色彩

    6. 实战案例：一图流论文

    • 一图集成分组、统计、出版美化，论文通用！

    7. 资源推荐

    总结：
    ggpubr 让 R 科研绘图一条龙，从美化、分组、统计到导出图片全搞定，是“论文直通车”型包。
    建议与 patchwork、ggplot2 语法结合，灵活应对各种科研场景。
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