📦scRNAseq

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📌 简介

scRNAseq 是 Bioconductor 提供的一个数据包，专门收录了多个整理好的 单细胞转录组测序（scRNA-seq）公共数据集。
它不包含任何分析函数，主要用于：
  • 单细胞分析入门
  • 测试新方法
  • 作为教学和演示用数据来源
返回对象通常为 SingleCellExperiment 类，可直接与 scater、Seurat 等分析工具结合使用。

📦 数据来源与内置数据集

该包将原始公共数据集整理为统一格式，目前常用的有：
  • ZeiselBrainData() — 小鼠脑细胞转录组
  • MacoskoRetinaData() — 视网膜细胞转录组
  • PaulHSCData() — 造血干细胞转录组
  • 其他数据集可通过 help(package="scRNAseq") 查看完整列表

🚀 快速上手示例

运行结果将返回一个 SingleCellExperiment 对象，可直接用于下游分析和可视化。

🔗 参考链接

📝 备注

  • 该包仅作为数据来源，不提供差异分析、降维、聚类等功能。
  • 加载的数据可无缝衔接到 scater、scran、Seurat 等 R 包中。
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