Lazy loaded imageSMR 共定位分析

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Jul 25, 2025
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smr-coloc-analysis
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SMR 共定位分析全流程：从 GWAS/eqtl 数据预处理，到 SMR 命令行与 R 批量脚本，完整记录数据标准化、cis 区间提取与批量分析实操。
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R
SMR
共定位分析
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📈 R Visionary
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1. 包安装与加载

2. 读取与标准化 Outcome GWAS

3. SMR 命令行示例

参考

4. R 脚本：批量构建 ESD & 提取 cis 区间

5. 批量 SMR 分析

6. 注意事项 & 补充

  • 字段顺序与名称务必一致，任何微小差异都会报错或无效结果。
  • 建议在每步之后对输出的 .esd、.flist 及中间文件进行 spot-check。
  • .list 文件请用 UTF-8 无 BOM 文本，每行一 ID，无额外空格。
  • 可将此脚本封装为 shell 或 makefile，适配大型批量分析。

7. 参考资料

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